PCR擴增儀|PCR基因擴增儀|PCR常見問題
一、沒有擴增產(chǎn)物 1、循環(huán)溫度:變性溫度、退火溫度 2、引物設(shè)計 3、DNA聚合酶活性 4、抑制性成份(蛋白酶、核酸酶、其它抑制聚合酶活性的成份) 5、DNA樣品
二、非特異產(chǎn)物及電泳呈涂布狀 1、Mg2+濃度 2、調(diào)整引物、模板、聚合酶的用量 3、適當(dāng)減少循環(huán)數(shù) 4、適當(dāng)提高退火溫度,縮短退火或延伸時間?
三、引物二聚體的形成 1、檢查引物的序列 2、提高退火溫度 3、調(diào)整引物與模板濃度 4、增加引物長度
四、假陽性結(jié)果的預(yù)防 1、實驗器材應(yīng)一次性使用(吸咀、PCR管) 2、注意操作環(huán)境,戴一次性手套 3、嚴(yán)格PCR操作規(guī)程 4、多次取樣的試劑應(yīng)分裝 5、設(shè)置陰性對照和陽性對照
PCR相關(guān)技術(shù)
一、錨定PCR(anchored PCR):引進錨定引物,可以幫助克服序列未知或序列未全知的障礙。在DNA3’-末端加上poly(dG)尾,與此相對應(yīng)的錨定引物poly(dC)一般應(yīng)在十二聚以上。
二、稱PCR(asymmetric PCR)不對稱PCR主要是在PCR體系中設(shè)計不同的引物濃度,兩條引物濃度比為1:50或1:100,前12個循環(huán)兩條模板等量擴增,之后低濃度引物消耗殆盡,其擴增產(chǎn)物減少以至于無;而高濃度引物介導(dǎo)產(chǎn)生的擴增產(chǎn)物(即單鏈DNA)逐漸增加,可得到大量單鏈DNA(ssDNA)用于直接測序。
三、反向PCR(inverse PCR)
四、多重PCR(multiplex PCR) 多重PCR是用多對引物同時對模板DNA上的多個區(qū)域進行擴增。多重PCR技術(shù)的難點不是在于其原理和操作的復(fù)雜性,而是在于其多對引物的設(shè)計,必需保證多對引物之間不形成引物二聚體,引物與目標(biāo)模板區(qū)域具有高度特異性。應(yīng)用于基因診斷,對與疾病相關(guān)的基因(龐大)進行擴增檢測。
五、逆轉(zhuǎn)錄PCR(reverse?transcription?PCR,RT-PCR) 由mRNA逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cDNA鏈作為PCR反應(yīng)模板。逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA時,引物可選用特異引物、隨機六聚體引物或寡聚dT(12-18)。設(shè)計RT-PCR的引物時最好是分散在不同的外顯子上,以免基因組DNA的污染導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
六、差別PCR(differential PCR) 差別PCR是將靶基因與已知拷貝的參照基因置于同一PCR反應(yīng)體系中,用同一套引物進行擴增,電泳染色后可根據(jù)參照基因的擴增產(chǎn)物與待測基因擴增產(chǎn)物的相對豐度對待測基因進行定量。
七、原位PCR(In situ PCR) 原位PCR是指在組織或細胞標(biāo)本片上直接進行PCR,對細胞中的靶DNA進行擴增,通過摻入標(biāo)記基團直接顯色或結(jié)合原位雜交進行檢測的方法。可分為直接法和間接法?;静襟E:組織切片或細胞固定→蛋白酶消化→原位PCR擴增→沖洗→產(chǎn)物檢測優(yōu)點:靈敏度高,可進行細胞內(nèi)定位。
八、熒光定量PCR(FQ-PCR) 熒光定量PCR:融匯PCR技術(shù)、DNA探針雜交技術(shù)(標(biāo)記有熒光報告基團和熒光淬滅基團),結(jié)合先進的光譜檢測技術(shù)發(fā)展起來的一項新技術(shù)。主要原理是在待擴增區(qū)域結(jié)合上DNA探針,PCR過程中,具有5’→3’外切酶活性的Taq酶延伸引物鏈到DNA探針時,將DNA探針逐個降解,釋放出熒光報告基團,這樣PCR體系中熒光的強度與PCR產(chǎn)物量之間存在正比關(guān)系,可通過測定熒光強度而對PCR產(chǎn)物定量。