主要儀器試劑
儀器:微型電泳系統(tǒng)、電源、注射器、固定和染色用容器
試劑:丙稀酰胺、雙-丙稀酰胺、載體兩性電解質(zhì)、尿素、過(guò)硫酸胺、TEMED、TritonX-100、2-巰基乙醇、溴酚藍(lán)、磷酸、氫氧化鈉、氯化鉀、三氯乙酸、考馬斯亮藍(lán)、甲醇、乙酸。
儲(chǔ)存液:1)30%(w/v)丙稀酰胺,1%(w/v)雙-丙稀酰胺;2)20%Triton X100;3)10%三氯乙酸;4)1%三氯乙酸;5)1%溴酚藍(lán);6)考馬斯亮藍(lán)染色液;7)考馬斯亮藍(lán)脫色液;
灌膠
以灌制8cm×7cm×0.75mm pH4-6變性等電聚焦凝膠的配方。其他pH范圍等電聚焦可以參考表格來(lái)配置。
水:5.4ml; 儲(chǔ)存液1):2.0 ml; 載體兩性電解質(zhì)溶液pH3.5-10 48μl; 載體兩性電解質(zhì)溶液pH4-6 240μl; 超純尿素 6.0 g ;10%過(guò)硫酸胺25μl; TEMED:20μl
灌膠步驟:
1.組裝灌膠器;
2.將尿素、水、溶液和載體兩性電解質(zhì)溶液混勻,避免劇烈搖動(dòng),輕微加熱尿素溶解更快(帶手套,丙稀酰胺有毒);
3.加入過(guò)硫酸胺和TEMED,輕輕混勻(開(kāi)始聚合,操作要迅速);
4.將上述混勻溶液倒如灌膠器(盡量避免氣泡產(chǎn)生);
5.插入梳子,將梳子侵入膠內(nèi)(不要產(chǎn)生氣泡);
6.聚合約1小時(shí);
7.聚合完成,小心拔去梳子;
8.將凝膠同冷卻裝置連接后插入電泳池,蛋白樣品上樣前最好用陽(yáng)極電極液注入上槽中確定是否有滲漏。
注意:
1.上樣前沖去上樣空底部未聚合的丙稀酰胺,否則電泳過(guò)程中會(huì)發(fā)生聚合;
2.現(xiàn)在有商品化的等電聚焦凝膠,但只限于水平平板電泳系統(tǒng)(如Pharmmacia-LKB,Hoefer).
樣品制備和上樣
一般不同厚度的凝膠,不同的梳孔數(shù)目會(huì)有不同的上樣量,例如:0.75mm厚、15孔的凝膠每孔最大上樣量大約15μl。
變性凝膠上樣緩沖液2×Buffer(適用于pH4-6):1)尿素:2.4g;2)pH3.5-10載體兩性電解質(zhì):20μl;3)pH4-6載體兩性電解質(zhì):100μl;4)20%Triton X-100:500μl:5)2-巰基乙醇:50μl;雙蒸水:1.7ml;1%溴酚藍(lán):200μl
電泳:
操作步驟:
1.將蛋白樣品于等體積的2×上樣緩沖液混合,10000×g離心5min以除去蛋白質(zhì)沉淀;
2.用微量注射器將蛋白質(zhì)樣品加入到上樣空底部,注意不要溢出來(lái)。注意:對(duì)于考馬斯亮藍(lán)染色液來(lái)說(shuō),每個(gè)泳道10-30μg的蛋白混合粗提物(我們俗稱粗抗原)或者5-10μg單一蛋白組分是較合理的上樣濃度。
電泳液:
1.上槽中加入陰極電泳液(20mM氫氧化鈉:須由1M儲(chǔ)存液新鮮配置);
2.下槽中加入陽(yáng)極電泳液(10mM磷酸:須由1M儲(chǔ)存液新鮮配置)。
等電聚焦電泳條件:
1.接好電極;
2.恒壓150V電泳30min;
3.恒壓200V電泳2.5h,開(kāi)始時(shí)候控制電流為10mA左右,在聚焦過(guò)程中電流有所下降,電泳內(nèi)室溫度在電泳的過(guò)程中將升至40-50攝氏度。
電泳聚焦后處理:
測(cè)定pH梯度:
1.將凝膠條切成0.5cm或1cm的小片;
2.將每小片凝膠在1ml 10mM KCl中 浸泡30min;
3.測(cè)讀此KCl溶液的pH值、
凝膠的固定:
1.將凝膠于10%三氯乙酸中浸泡10min;
2.換成1%三氯乙酸溶液繼續(xù)浸泡至少2h以上,以去除載體兩性電解質(zhì),浸泡過(guò)夜可以更好的降低考馬斯亮藍(lán)對(duì)載體兩性電解質(zhì)的染色。
凝膠的染色:用考馬斯亮藍(lán)染色,然后脫色,制成干膠。
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DYCP-37B 等電聚焦多用途電泳槽
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等電點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)蛋白(pH3-pH10)試劑盒
所有的氨基酸均為兩性物質(zhì),即它們至少含有一個(gè)羧基(carboxyl)及一個(gè)氨基(α-amino)。這些可游離的基團(tuán)隨著pH變化可以三種形式存在,即正電荷(cation)、兩性離子(zwitterion)及負(fù)電荷(anion)等三種,在酸性溶液中帶正電荷,在堿性溶液中帶負(fù)電荷。若氨基酸在某一pH值下其凈電荷為0,且在電場(chǎng)中不移動(dòng)時(shí),稱此pH值為它的pI值(等電點(diǎn))。
關(guān)鍵詞:電泳酰胺聚丙烯聚丙烯酰胺等電聚焦電泳蛋白質(zhì)等電點(diǎn)等電聚焦電泳isoelectricfocusingIEF
實(shí)驗(yàn)原理
所有的氨基酸均為兩性物質(zhì),即它們至少含有一個(gè)羧基(carboxyl)及一個(gè)氨基(α-amino)。這些可游離的基團(tuán)隨著pH變化可以三種形式存在,即正電荷(cation)、兩性離子(zwitterion)及負(fù)電荷(anion)等三種,在酸性溶液中帶正電荷,在堿性溶液中帶負(fù)電荷。若氨基酸在某一pH值下其凈電荷為0,且在電場(chǎng)中不移動(dòng)時(shí),稱此pH值為它的pI值(等電點(diǎn))。因?yàn)閮綦姾蔀榱悖瑑綦姵饬Σ淮嬖诘木壒?,大部份蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的pH值下,其溶解度最小。相反的,當(dāng)溶液的pH值低于或高于pI,所有蛋白質(zhì)分子所帶凈電荷為同號(hào),彼此之間有相斥力,不會(huì)聚集。所以,將pH調(diào)到等電點(diǎn)的大小,則大部份的蛋白質(zhì)將會(huì)沉淀,這種現(xiàn)象可以應(yīng)用于估算某蛋白質(zhì)的等電點(diǎn);另一方面,也可以應(yīng)用在電泳,達(dá)到分離蛋白質(zhì)混合物的目的,這種方法稱為等電聚焦電泳(isoelectric focusing),簡(jiǎn)稱為IEF(見(jiàn)圖4.8)。
圖4.8 等電聚焦電泳示意圖
上圖左以A,B兩種蛋白質(zhì)為例,作出它們的凈電荷曲線圖,橫軸代表環(huán)境中的pH值,縱軸代表蛋白質(zhì)的凈電荷,在 pH 6.5時(shí),A帶有兩個(gè)正電荷,B帶有一個(gè)負(fù)電荷。使A與B的凈電荷為0的pH值分別為pH9和pH5,這就是它們的「等電點(diǎn)」。
IEF是在具有pH梯度環(huán)境中進(jìn)行的電泳。將蛋白質(zhì)置于不同pH梯度的膠體進(jìn)行電泳,它會(huì)朝著與自身所帶電荷相反的電極方向移動(dòng),直到抵達(dá)等電點(diǎn)(pI)相同的pH值處才停止,如果它移到別的pH處,會(huì)因?yàn)閹щ姸俣纫苿?dòng)到和它pI相符的pH處。
IEF-PAGE操作簡(jiǎn)單,只要一般電泳設(shè)備就可進(jìn)行,電泳時(shí)間短、分別率高、應(yīng)用范圍廣,可用于分離蛋白質(zhì)及測(cè)定pI,也可用于臨床鑒別診斷、農(nóng)業(yè)、食品研究等各種領(lǐng)域。
試劑和器材
一、試劑
Acr-Bis貯存液:29.1g Acr,0.9g Bis, 用無(wú)離子水溶解后定容至100ml,不溶物過(guò)濾去除后置棕色瓶貯于冰箱。
等電點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)蛋白(pH3-pH10)試劑盒,臨用前稀釋至0.1-0.3mg/mL。
適合于pH3-pH10范圍的電極溶液:
A: 陰極電極溶液(1mol/L NaOH):稱NaOH(AR)4g,加去離子水使其溶解,冷卻至室溫再定容至100ml;
B: 陽(yáng)極電極溶液(1mol/L H3PO4):取H3PO4(85%)6.7ml,加去離子水定容至100ml。
固定液:稱取磺基水楊酸3.5g,三氯乙酸10ml,甲醇35ml,加去離子水至100ml。
染色液:稱取考馬斯亮藍(lán)R250 0.1g,冰乙酸10ml,甲醇35ml,加去離子水使其完全溶解,在定容至100ml,過(guò)濾后置棕色瓶保存。
脫色液:取無(wú)水乙醇50ml,冰乙酸20ml,加蒸餾水至200ml。
保存液:取無(wú)水乙醇25ml,冰乙酸10ml, 甘油5ml,加蒸餾水至100ml。
10%過(guò)硫酸銨,TEMED, 40%兩性電解質(zhì)載體(pH3-pH10)。
二、材料
待測(cè)已純化的蛋白質(zhì)樣品(脫鹽),濃度0.5mg/mL。
三、器材
等電聚焦電泳槽, 移液管(1,5,10ml),燒杯(25,50,100ml),細(xì)長(zhǎng)頭的吸管,微量注射器(10μL或者50μL),漏斗,濾紙,鑷子。
操作方法
一、準(zhǔn)備工作
配制凝膠前,應(yīng)把玻璃板準(zhǔn)備好。即將兩塊干凈的玻璃板疊放在一起,之間夾上所需凝膠厚度的膠條進(jìn)行密封。然后用文具夾將玻璃板四周固定好。注意夾子作用力點(diǎn)在膠條正中,以防漏膠。
二、配制凝膠
取Acr-Bis儲(chǔ)備液2.0ml;兩性電解質(zhì)0.5ml;去離子水5.5ml;TEMED 8μl置于小燒杯中混勻,再加入10% 過(guò)硫酸胺50μl,用磁力攪拌器充分混勻2min。然后用注射器吸凈混合液,排除氣泡,緩緩注入玻璃板的夾隙內(nèi)。注意勿出現(xiàn)氣泡。
三、電泳
1. 剝膠板 將膠板取出,揭去上層的玻璃板和膠條,然后用蒸餾水輕輕沖洗一下膠面。
2. 點(diǎn)樣 用小紙條(0.5 cm′0.5cm)蘸樣,均勻地點(diǎn)在膠板上,點(diǎn)樣要求整齊、迅速。注意膠板兩邊要留出一定空間。通常把PI在酸性范圍的樣品放在偏堿性的位置(負(fù)極),PI偏酸性的樣品放在偏酸性的位置(正極),標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)混合樣品放在中間。
3. 進(jìn)樣 將浸入電極液的濾紙條取出,使其分別平直緊貼在膠面兩端,然后放入電泳槽內(nèi),注意正負(fù)極相吻合。將電極板正極(電極條浸有H3PO4的一側(cè))與負(fù)極(電極條浸有NaOH的一側(cè))分別與電泳儀的正、負(fù)極連接。接通冷卻水,在室溫下電泳,把電泳儀調(diào)至電壓50V,電流以每板膠不超過(guò)17mA為準(zhǔn),然后開(kāi)始電泳。進(jìn)樣時(shí)間一般在1.5-2小時(shí)。
4. 揭樣紙 待電流降至每板膠3mA以下時(shí),切斷電源,取出膠板,揭去加樣紙后,將電壓調(diào)至220~320V繼續(xù)電泳。5. 加壓 當(dāng)電流降至每板膠3mA以下時(shí),升高電壓至580V,繼續(xù)電泳1.5小時(shí)左右。
6. 電流降至每板3mA以下時(shí),切斷電源,停止電泳。
四、固定、,染色和脫色
將凝膠板放在培養(yǎng)皿中,加入固定液,浸泡數(shù)小時(shí)后,用脫色液清洗兩次,每次10min, 然后加入染色液,室溫下放置15-30min,再用脫色液洗脫數(shù)次,直至譜帶清晰,放入保存液中浸泡10min,可制干板。
五、制作干膠板
1. 取完全浸濕的平整玻璃紙一張,于玻璃板上鋪平,紙與板之間不可有氣泡。
2. 將凝膠鋪于上述玻璃紙上,對(duì)齊中心位置,使四邊留出距離相等,隨后將膠與紙之間的氣泡輕輕趕跑。然后,把另一張玻璃紙折起蓋在膠面上,并與下層玻璃紙對(duì)齊,膠與兩層玻璃紙之間要絕對(duì)避免氣泡,要求光滑平整。
3. 將凝膠四邊上下兩層玻璃紙貼緊,使膠邊邊緣上完全沒(méi)有氣泡。然后將各邊的玻璃紙多余部分折向玻璃板反面。
4. 置于室溫中自然干燥,完全干燥后的膠板,手感如觸及玻璃板。這時(shí),可將膠板揭下,裁去邊角多余的紙,即可得一張圖譜清晰的干膠板。
注意事項(xiàng)
(1)支持介質(zhì)
在IEF-PAGE中,丙烯酰胺純度極為重要,Acr及Bis中如有丙烯酸,則引起聚焦后pH剃度漂移,一般需用重結(jié)晶法進(jìn)一步純化Acr及Bis。 最近Pharmacia公司推出Amberlite MB-6除去丙烯酸,其效果較再結(jié)晶法更佳。
(2)兩性電解質(zhì)載體
兩性電解質(zhì)載體是IEF-PAGE中最關(guān)鍵的試劑,直接影響pH梯度的形成,以及蛋白質(zhì)
的聚焦。因此,要選用優(yōu)質(zhì)的兩性電解質(zhì)載體,在凝膠中,其終濃度一般為1-2%。pH梯度的線性依賴于兩性電解質(zhì)的性質(zhì),選擇哪種pH梯度范圍的兩性電解質(zhì)載體,則與被分離蛋白質(zhì)的pI有關(guān)。
(3)樣品預(yù)處理與加樣方法
實(shí)驗(yàn)證實(shí),鹽離子可干擾pH梯度形成,并使區(qū)帶扭曲。為了防止上述影響,進(jìn)行IEF-PAGE時(shí),樣品應(yīng)透析或用Sephadex G-25脫鹽,也可將樣品溶解在水,或是低鹽緩沖液中,使其充分溶解,以免不溶小顆粒引起拖尾。但某些蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)附近,或水溶液及低鹽溶液中,溶解度較低,則可在樣品中加入兩性電解質(zhì),如加入1%甘氨酸或?qū)?%甘氨酸透析,雖然甘氨酸是兩性電解質(zhì),但不影響pH梯度的形成,可利用其在溶液中的偶極距作用增加蛋白質(zhì)的溶解性。此外,還可在樣品及凝膠溶液中加入無(wú)離子去污劑如Tween 80, Triton X-100, Nonide P-40等或加入相同濃度的尿素(4 M),以免氰酸鹽引起蛋白質(zhì)的胺甲酰化,含有尿素的樣品及凝膠板只能當(dāng)天使用。
加樣量取決于樣品中蛋白質(zhì)的種類、數(shù)目及檢測(cè)方法的靈敏度。如用銀染色,加樣量可減少到1 μg。一般樣品濃度以0.5-3 mg/ml為宜,最適加樣體積為10-30 μl。如樣品很濃,可直接在凝膠表面加2-5 μl;如樣品很稀,可加樣300μl。值得注意的是:對(duì)不穩(wěn)定的樣品可先將凝膠進(jìn)行15-30 min預(yù)電泳使pH梯度形成,然后將樣品放再靠近pI的位置以縮短電泳的時(shí)間,但不要將樣品正好加在pI處和緊靠陽(yáng)、陰極的膠面上,以免引起蛋白質(zhì)變性造成區(qū)帶扭曲。一般加樣電泳半小時(shí)后,取出加樣濾紙以免引起拖尾現(xiàn)象。
(4)電功率、時(shí)間等因素
在IEF電泳中,隨著樣品的遷移越接近pI時(shí),電流則越來(lái)越小。為使各成分能更好
地分離,要保持一定的電功率,就應(yīng)不斷增加電壓,電壓增高可縮短pH梯度形成,和蛋白質(zhì)分離所需的時(shí)間,但過(guò)高的電壓會(huì)使凝膠板局部范圍過(guò)熱,因此,在電泳過(guò)程中,應(yīng)通冷卻水,水溫以4-10℃為宜,流量5-10 l/min。一般寬pH范圍電泳時(shí)間以1.5-2 h為宜。
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聚丙烯酰胺凝膠平板等電聚焦電泳測(cè)定蛋白質(zhì)等電點(diǎn)(圖)